Mahasiswa Politeknik Negeri Jember tidak hanya dibimbing untuk menjadi tenaga ahli sesuai bidangnya, namun juga didorong untuk menjadi masyarakat yang memiliki nilai lebih dengan soft skill-nya, misalnya kemampuan leadership, manajemen diri, manajemen acara hingga kemampuan berkomunkasi.
Salah satu ruang terbaik mahasiswa untuk mengembangkan kemampuannya adalah melalui organisasi. Organisasi yang dinaungi oleh Politeknik Negeri Jember diantaranya adalah Badan Eksekutif Mahasiswa, Majelis Permusyawaratan Mahasiswa, Himpunan Mahasiswa Jurusan, serta Unit Kegiatan Mahasiswa. Organisasi tersebut beranggotakan mahasiswa untuk mewadahi bakat, minat dan potensi mahasiswa yang dilaksanakan di dalam kegiatan ko dan ekstra kurikuler.